Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A10Q6U841 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms