Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC12Q6PEW1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZCCHC12Q6PEW1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms