Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms