Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM29Q5VYK3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms