Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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