Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms