Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms