Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms