Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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LAMA3Q16787 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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LAMA3Q16787 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LAMA3Q16787 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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