Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYPL1Q16563 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms