Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms