Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS72Q15906 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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