Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCF4Q15080 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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