Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERC3Q15034 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms