Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMD6Q15008 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMD6Q15008 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms