Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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UBE4AQ14139 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE4AQ14139 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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