Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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