Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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