Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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SHROOM2Q13796 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
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