Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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