Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms