Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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