Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATMQ13315 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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