Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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TRAF1Q13077 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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TRAF1Q13077 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TRAF1Q13077 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF1Q13077 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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