Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MKRN3Q13064 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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