Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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