Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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NPRL3Q12980 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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