Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STX4Q12846 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STX4Q12846 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STX4Q12846 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STX4Q12846 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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