Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCAPQ12770 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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