Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms