Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRSF4Q08170 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms