Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms