Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL9Q07325 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms