Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABPAQ06546 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms