Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNC4Q03721 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms