Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms