Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms