Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPCQ01831 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPCQ01831 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPCQ01831 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPCQ01831 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms