Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDKL1Q00532 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms