Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FGD1P98174 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FGD1P98174 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FGD1P98174 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms