Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HTRA4P83105 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HTRA4P83105 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms