Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms