Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPNP63162 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms