Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms