Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPZ1P61923 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPZ1P61923 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms