Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF3P57682 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF3P57682 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms