Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLTPP55058 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLTPP55058 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLTPP55058 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms