Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX2P52951 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms