Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP4P49662 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP4P49662 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP4P49662 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms