Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCLCP48506 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GCLCP48506 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCLCP48506 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCLCP48506 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCLCP48506 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCLCP48506 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GCLCP48506 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms